La segmentation consiste à identifier un ou plusieurs objet(s) dans une image ou un volume. C’est une étape fondamentale et préalable à toute analyse quantitative de données médicales. Divers phénomènes peuvent cependant rendre cette phase complexe et une solution fréquemment envisagée est l’introduction de connaissances expertes pour guider l’algorithme de segmentation.
Dans ce cours, nous verrons comment ces a priori peuvent être introduits pour 3 types de méthodes particulières: les contours actifs, les atlas et des techniques d’apprentissage. Des exemples issus d’articles scientifiques viendront illustrer cette partie théorique par différentes applications cliniques (coeur, cerveau, cancer, …) et différentes modalités d’imagerie (IRM, CT, échographie).