Proposition de stage : Automatisation de l’analyse de données électrophysiologiques

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Type de stage

Sciences de l’ingénieur, informatique, traitement du signal.
École d’Ingénieur (2e année mini), Licence (L2L3) ou Master 1

Date ou durée du stage

2 à 3 mois

Contexte

Ce travail s’effectuera en soutien à plusieurs projets de recherche portant sur l’analyse de biomarqueurs électrophysiologiques acquis chez des patients atteints d’affections neurologiques (AVC, Sclérose latérale amyotrophique). Les signaux électromyographiques (EMG) sont acquis avec le CED Power 1401 et le logiciel Signal.

Diverses conditions expérimentales sont testées avec des signaux EMG conditionnés ou non par une ou plusieurs stimulations. Les données acquises dans Signal sont exportables dans divers formats (.mat, .csv, .txt, etc.). Les biomarqueurs reposent essentiellement sur l’amplitude et la moyenne temporelle de chaque essai, moyenne des essais (écart-type et écart-type de la moyenne), etc.

Objectif et missions

Développer des codes pour automatiser l’analyse des données d’électrophysiologie et les comparer aux analyses classiquement faites avec le logiciel Signal qui nécessite plusieurs étapes manuelles :

  • Formation aux analyses électrophysiologiques dans Signal
  • Exportation des données
  • Développement de codes d’analyse (Matlab ou Python)
  • L’étudiant pourra assister à des expériences pour la collecte de données.

Compétences

  • Maîtrise de Matlab et Python 3.
  • Traitement du signal

Rémunération

Sans rémunération, mais possibilité de prolonger avec rémunération

Lieu du stage

LIB-MPR, Service de Rééducation, Hôpital Pitié-Salpêtrière, 47 bd de l’Hôpital, 75013 Paris

Contact

Véronique Marchand-Pauvert
veronique.marchand-pauvert[at]inserm.fr
Tél. : 01 42 16 11 20