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Contexte
Les anticorps antinucléaires sont communément recherchés par immunofluorescence indirecte sur cellules Hep-2 dans le sérum des patients pour diagnostiquer des maladies autoimmunes systémiques comme le lupus systémique ou le syndrome de Gougerot Sjögren. Cet examen biologique repose sur la reconnaissance de pattern de fluorescence de différentes structures nucléaires et cytoplasmiques au microscope par le biologiste. Le raisonnement du biologiste est fondé sur l’analyse de critères morphologiques cellulaires bien précis.
Objectif
Mettre au point un algorithme traduisant le raisonnement du biologiste lors de la reconnaissance de patterns de fluorescence
Mission(s)
- Connaître la démarche du biologiste dans la recherche d’anticorps antinucléaires par immunofluorescence indirecte sur cellules Hep-2 au laboratoire
- Mettre en place les règles de segmentation de pattern de fluorescence
- Mise au point d’un algorithme
- Validation de l’alogrithme
Compétences
- OBLIGATOIRE. Expériences, connaissances et compétences demandées pour postuler au stage.
- Expérience de développement informatique (Matlab, C/C++, Java), connaissances en traitement d’images, en particulier reconnaissance de formes, classification. Une forte curiosité, une capacité de travail en collaboration / équipe ainsi qu’un caractère constructif seront très appréciés.
Durée du stage
- Janvier-juin 2016
Rémunération
- Gratifications de stage
Contacts
Pr. Daniel Racoceanu
Sorbonne Université – Université Pierre et Marie Curie (UPMC Univ Paris 06)
Institut Universitaire d’Ingéniérie pour la Santé
Laboratoire d’Imagerie Biomédicale
CNRS UMR 7371 – INSERM U 1146
Faculté de Médecine Pierre et Marie Curie, 91 Bd de l’Hôpital, #205
F-75634 PARIS CEDEX 13 (France)
Dr Makoto MIYARA, Praticien hospitalier, MD-PhD, HDR
Département d’Immunologie: Immunochimie et Autoimmunité (Dr MUSSET)
INSERM, U1135, CIMI (Centre d’immunologie et des maladies infectieuses)
Groupe Hospitalier Pitié-Salpètrière
47-83 Bd de l’Hopital
75651 Paris Cedex 13, France
telephone: +33 1 42 17 84 91
fax: +33 9 55 23 84 56
