Proposition de stage M2 ou dernière année d’école d’ingénieur 2015-2016 : Développement et validation d’un outil de segmentation 3D de l’aorte en IRM.

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Contexte :

Les maladies cardiovasculaires sont responsables de la moitié des décès en Europe, avec un coût estimé à 200 milliards / an. L’aorte, artère la plus large du corps humain, assure l’alimentation en sang de l’organisme et permet d’assurer un débit continu du sang en dépit du fonctionnement pulsé du cœur. Cependant, diverses atteintes vont engendrer une modification des propriétés géométriques et mécaniques de la paroi aortique et par conséquence  une réduction de la performance du système circulatoire central.

Les récentes avancées dans le domaine de l’IRM permettent d’imager l’aorte en 3D au cours du temps ainsi que de mesurer les vitesses sanguines dans celle-ci. Une analyse efficace de ces données nécessite cependant une étape de segmentation de l’aorte à partir de laquelle des paramètres physiologiques pourront être extraits et exploités.

Objectif :

Une méthode de segmentation semi-automatique nécessitant la délinéation de 7 repères anatomiques a été développée au sein de l’équipe iCV du LIB. Cependant, le résultat de segmentation n’est pas satisfaisant dans les zones à fortes courbures (auto-intersection du contour). L’objectif du stage est donc d’introduire une contrainte de régularisation dans ces zones et de valider la technique de segmentation sur une base de données de patients sains ou hypertendus.

Mission(s) :

  •  Etude bibliographique (segmentation de l’aorte, validation clinique, …)
  •  Introduction d’une contrainte de régularisation dans le formalisme utilisé pour la segmentation
  •  Validation de la technique sur une base de données (définition des métriques, références, comparaison avec d’autres méthodes…)
  • Extraction de paramètres cliniques utiles au diagnostic

Compétences

  •  Connaissances en traitement d’images
  • Programmation en Matlab et / ou C++ (ITK, VTK)

Rémunération

Gratifications de stage.

Contacts

  • Thomas Dietenbeck (thomas.dietenbeck[at]upmc.fr)
  • Nadjia Kachenoura (nadjia.kachenoura[at]inserm.fr)

Date et durée du stage

  • 6 mois (à partir de janvier 2016)