Proposition de stage : Organisation des bases de données et annotation des images sur les projets d’IRM aortique

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Type de stage

Stage d’Attaché.e de Recherche Clinique ou équivalent

Durée et localisation

4 à 6 mois à compter de février 2025

Contexte

Les maladies cardiovasculaires impliquent souvent une atteinte de l’aorte, la plus grosse artère située en sortie du cœur qui véhicule le sang oxygéné vers tout l’organisme. En effet, à chaque battement cardiaque, l’aorte subit des contraintes mécaniques sous haute pression qui peuvent être accentuées par des conditions très répandues dans la population générale telles que l’hypertension, le diabète ou l’obésité, et qui altèrent la géométrie aortique mais aussi les propriétés élastiques de sa paroi, ainsi que l’écoulement du sang y circulant. Cependant à ce jour, seule la mesure du diamètre aortique, réalisée sur des images médicales en 2D, est considérée pour diagnostiquer, évaluer le degré de sévérité et opérer les patients atteints de maladies aortiques, telles que l’anévrisme, alors que la rupture peut survenir même à des diamètres en-dessous des seuils recommandés. Notre hypothèse est que l’évaluation multiparamétrique des altérations aortiques offerte par l’IRM : au niveau fonctionnel, de la paroi et de l’hémodynamique, en complément et au-delà de la géométrie, fournirait une prédiction du risque personnalisée plus précise et ainsi une prise en charge individuelle plus adaptée à chaque patient.

L’équipe d’imagerie cardiovasculaire (iCV) du Laboratoire d’Imagerie Biomédicale (LIB, Sorbonne Université) est spécialisée dans le développement de logiciels pour faciliter et accélérer l’analyse des images IRM aortiques, et a conçu plusieurs outils pour fournir des mesures de la géométrie, l’élasticité et l’hémodynamique du flux sanguin de l’aorte thoracique.

Objectif

Le but de ce stage sera de :

  1. organiser la base de données IRM de l’aorte thoracique
  2. réaliser les annotations manquantes sur les images aortiques à partir des logiciels développés dans l’équipe

Mission(s)

L’Attaché.e de Recherche Clinique aura pour missions de :

  • organiser la base de données IRM de l’aorte thoracique déjà disponible dans l’équipe, provenant de plusieurs protocoles de recherche (~500 volontaires sains et patients atteints de diverses maladies cardiaques et aortiques, acquisitions réalisées sur des machines Siemens et General Electric, aux champs magnétiques 1,5 et 3T, des Hôpitaux Pitié-Salpêtrière et Européen Georges Pompidou) ;
  • récupérer les nouvelles images pour les protocoles en cours d’inclusion ;
  • réaliser les annotations manquantes sur les images anatomiques et hémodynamiques 2D et 3D à partir de logiciels développés dans l’équipe : tâches de pré-traitement et segmentation de l’aorte ascendante et descendante ;
  • interagir avec les membres de l’équipe (chercheurs, doctorant, ingénieure) qui développent les divers outils permettant de fournir les mesures quantitative de l’aorte à partir des images IRM, intégrant du traitement d’images conventionnel ainsi que de nouvelles approches en intelligence artificielle.

Compétences

  • Compétences organisationnelles
  • Qualités relationnelles
  • Rigueur
  • Outils de bureautique
  • Connaissances en physiologie cardiovasculaire et/ou imagerie médicale sont un plus.

Rémunération

Gratifications de stage

Contact

Emilie Bollache : emilie.bollache[at]inserm.fr