Proposition de stage : Traitement de données d’imagerie par résonance magnétique (IRM) chez des patients atteints de cardiomyopathie hypertrophique

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Type de stage

Master ou équivalent

Durée et localisation

Stage de 4 à 6 mois, basé au Core Lab au début du stage et ensuite sur le site des Cordeliers sur la deuxième partie du stage.

Contexte

La cardiomyopathie hypertrophique (CMH) est une maladie génétique, souvent autosomique dominante, qui touche environ 1 personne sur 500 dans la population générale. Elle représente une cause majeure de mort subite cardiaque (MSC), notamment chez les jeunes et les athlètes de moins de 35 ans. Actuellement, la seule prévention efficace de la MSC, en dehors de la limitation des activités physiques intenses, repose sur l’implantation d’un défibrillateur automatique implantable (DAI). Cependant, les recommandations pour l’implantation d’un DAI, émises par différentes sociétés savantes, sont variables et basées sur des études rétrospectives et présentent plusieurs limites, notamment : un manque de puissance prédictive des critères utilisés, une absence de prise en compte de nouveaux marqueurs de risque, des seuils d’implantation parfois arbitraires, etc.

Ces lacunes soulignent l’urgence de développer de nouveaux outils pour guider la prise de décision clinique. L’objectif principal de la recherche dans laquelle s’intègre ce stage est de développer un nouveau modèle de prédiction de la MSC chez les patients atteints de CMH, en intégrant des biomarqueurs innovants identifiés par l’imagerie (IRM cardiaque et échocardiographie) et la génétique. Une étude prospective nationale dans le cadre d’un PHRC (protocole hospitalier de recherche clinique) est en cours pour atteindre cet objectif impliquant 37 centres français et environ 1200 patients. La réception et l’analyse de l’ensemble des examens IRM en suivant un pipeline précis, guidé par les recommandations et l’innovation est gérée par l’équipe d’accueil.

Mission(s)

L’objectif du stage est de participer à différentes tâches de la réalisation de ce projet notamment :

  1. Contrôle qualité des données :
    • Assurer le contrôle qualité des données d’imagerie reçues au Core Lab.
    • Veiller à l’intégrité et à la complétude des données à l’aide de procédures standardisées.
  2. Export et analyse des biomarqueurs et des annotations (segmentations du muscle cardiaque) :
    • Exporter les biomarqueurs et les annotations d’imagerie IRM à l’aide de logiciels validés (commerciaux et académiques).
  3. Analyse des biomarqueurs et classification :
    • Réaliser des scripts simples (à partir de codes existants) pour la lecture de ces exports.
    • Réaliser une classification à partir des paramètres d’épaisseur du muscle cardiaque pour identifier différents patterns de CMH (hypertrophie septale, apicale, etc.).
  4. Collaboration et reporting :
    • Collaborer avec l’équipe du Core Lab et de l’unité d’imagerie cardiovasculaire et thoracique (ICT) pour réaliser les étapes d’analyse.
    • Rédiger des rapports synthétiques sur les analyses réalisées.

Profil recherché

  • Formation en informatique, biomédecine ou imagerie médicale (niveau Master ou équivalent).
  • Compétences en analyse d’imagerie médicale et utilisation de logiciels spécialisés.
  • Intérêt pour la recherche clinique et l’application des nouvelles technologies (IA).
  • Rigueur, autonomie et capacité à travailler en équipe multidisciplinaire.

Équipe d’accueil

Équipe d’imagerie cardiovasculaire, Laboratoire d’Imagerie Biomédicale, 15 rue de l’Ecole de Médecine, Paris 75006 (site des Cordeliers)

ICAN Imaging Core Lab, IHU ICAN, 52 boulevard Vincent Auriol, Paris 75013

Rémunération

Gratifications de stage mensuelles + remboursement partiel d’un titre de transport mensuel (environ 550-600€/mois selon la révision du coût horaire en janvier 2025 et des jours travaillés).

Contacts

Khaoula Bouazizi (khaoula.bouazizi[at]inserm.fr)
Nadjia Kachenoura (nadjia.kachenoura[at]inserm.fr)